Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms