Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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