Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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