Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PUM3-202ENST00000397885 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PAFAH2-202ENST00000374284 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 NR2E1-201ENST00000368983 2612 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 WIPF1-204ENST00000392547 4587 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ZMAT4-202ENST00000315769 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 RASGRP4-207ENST00000587738 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AC080013.1-204ENST00000607426 2185 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CLPB-201ENST00000294053 3240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CAV1-209ENST00000614113 3201 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 EPS8L3-203ENST00000369805 2325 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 GNG11-201ENST00000248564 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 LOXHD1-204ENST00000398705 1824 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 MIR194-2HG-201ENST00000413053 3647 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ZNF423-201ENST00000262383 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 MED29-201ENST00000315588 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 NR1I2-202ENST00000393716 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 GRM4-201ENST00000374177 3590 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AL139220.2-207ENST00000434244 2644 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ATP6V0A4-203ENST00000393054 3090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 TTC16-201ENST00000373289 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SLC5A11-209ENST00000567758 2246 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ALS2CL-201ENST00000318962 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms