Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms