Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms