Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX1P83916 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX1P83916 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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