Protein–RNA interactions for Protein: P54274

TERF1, Telomeric repeat-binding factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TERF1P54274 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TERF1P54274 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TERF1P54274 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TERF1P54274 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TERF1P54274 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TERF1P54274 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TERF1P54274 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TERF1P54274 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TERF1P54274 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TERF1P54274 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TERF1P54274 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TERF1P54274 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TERF1P54274 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TERF1P54274 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TERF1P54274 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TERF1P54274 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TERF1P54274 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TERF1P54274 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TERF1P54274 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TERF1P54274 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TERF1P54274 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms