Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBP50607 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBP50607 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBP50607 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBP50607 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBP50607 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBP50607 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBP50607 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBP50607 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBP50607 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBP50607 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBP50607 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBP50607 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBP50607 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms