Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ETV1P50549 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ETV1P50549 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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