Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms