Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTGFP29279 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTGFP29279 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTGFP29279 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTGFP29279 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTGFP29279 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTGFP29279 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTGFP29279 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTGFP29279 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTGFP29279 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms