Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms