Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms