Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DESP17661 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DESP17661 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DESP17661 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DESP17661 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DESP17661 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DESP17661 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DESP17661 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DESP17661 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DESP17661 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DESP17661 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DESP17661 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DESP17661 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DESP17661 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DESP17661 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DESP17661 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DESP17661 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DESP17661 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DESP17661 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DESP17661 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms