Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms