Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms