Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DENRO43583 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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