Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-1B6SEH8 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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