Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC169A6NNP5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC169A6NNP5 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms