Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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