Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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COPS3Q9UNS2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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