Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNMA3Q9UL41 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.2 ms