Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 AC007228.2-201ENST00000602145 1328 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PCDH10Q9P2E7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PCDH10Q9P2E7 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PCDH10Q9P2E7 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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PCDH10Q9P2E7 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PCDH10Q9P2E7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PCDH10Q9P2E7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PCDH10Q9P2E7 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PCDH10Q9P2E7 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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