Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SH3BP4Q9P0V3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SH3BP4Q9P0V3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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