Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL11Q9NVR0 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms