Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms