Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms