Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms