Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms