Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNS3Q9BQ31 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms