Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRIQ1Q96JM4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms