Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SPTSSAQ969W0 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SPTSSAQ969W0 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SPTSSAQ969W0 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SPTSSAQ969W0 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SPTSSAQ969W0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SPTSSAQ969W0 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SPTSSAQ969W0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SPTSSAQ969W0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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