Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD1Q8NHV4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms