Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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SMARCD3Q6STE5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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