Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ETFRF1Q6IPR1 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ETFRF1Q6IPR1 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ETFRF1Q6IPR1 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ETFRF1Q6IPR1 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ETFRF1Q6IPR1 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ETFRF1Q6IPR1 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ETFRF1Q6IPR1 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ETFRF1Q6IPR1 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ETFRF1Q6IPR1 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ETFRF1Q6IPR1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ETFRF1Q6IPR1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ETFRF1Q6IPR1 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ETFRF1Q6IPR1 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ETFRF1Q6IPR1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ETFRF1Q6IPR1 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ETFRF1Q6IPR1 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ETFRF1Q6IPR1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms