Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 NME6-211ENST00000447314 621 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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FAM208BQ5VWN6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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FAM208BQ5VWN6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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FAM208BQ5VWN6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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FAM208BQ5VWN6 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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FAM208BQ5VWN6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FAM208BQ5VWN6 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FAM208BQ5VWN6 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FAM208BQ5VWN6 AC010442.2-201ENST00000509301 407 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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FAM208BQ5VWN6 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FAM208BQ5VWN6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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