Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PRAMEF20Q5VT98 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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