Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms