Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC38Q502W7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC38Q502W7 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms