Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CNPY1Q3B7I2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms