Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CDO1Q16878 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CDO1Q16878 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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