Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HTR4Q13639 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HTR4Q13639 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HTR4Q13639 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HTR4Q13639 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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HTR4Q13639 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HTR4Q13639 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HTR4Q13639 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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HTR4Q13639 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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HTR4Q13639 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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HTR4Q13639 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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HTR4Q13639 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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HTR4Q13639 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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HTR4Q13639 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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HTR4Q13639 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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