Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CALCOCO2Q13137 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CALCOCO2Q13137 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CALCOCO2Q13137 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CALCOCO2Q13137 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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