Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms