Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LOXL1Q08397 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms