Protein–RNA interactions for Protein: P81408

FAM189B, Protein FAM189B, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM189BP81408 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM189BP81408 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms