Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2BP67870 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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