Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK8P49336 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK8P49336 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK8P49336 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK8P49336 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK8P49336 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK8P49336 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK8P49336 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK8P49336 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms