Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms